Connaître ce que l'on dépense et comprendre pourquoi on le dépense est un des moyens d'appréhender les problèmes de santé d'une population. C'est donc un des domaines de recherche de la CEM qui doit pouvoir argumenter le bien fondé des avis suite aux saisines de la Commission de nomenclature, être capable d'interpréter des données pour valider des études économiques et éventuellement mettre en évidence des problèmes de santé publique ou de pratiques médicales qui pourraient bénéficier d'une mise au point par le Conseil scientifique du domaine de la santé.
Les collaborateurs de la CEM travaillent régulièrement avec le service "Etudes et analyses" de l'Inspection générale de la sécurité sociale (IGSS) pour conduire différents travaux d'analyses statistiques demandés par les organisations internationales notamment l’Organisation de coopération et de développement économiques (OCDE) et l’Organisation mondiale de la Santé (OMS).